Вестник БГУ. Химия. Физика
Библиографическое описание:
, ПОИСК ПРИРОДНЫХ ПЕПТИДАЗ В МИКРОБНОМ МАТЕ ГОРЯЧЕГО ИСТОЧНИКА ГАРГА И ИХ РАЗНООБРАЗИЕ // Вестник БГУ. Химия. Физика. - 2020. №1. . - С. 45-53.
Заглавие:
ПОИСК ПРИРОДНЫХ ПЕПТИДАЗ В МИКРОБНОМ МАТЕ ГОРЯЧЕГО ИСТОЧНИКА ГАРГА И ИХ РАЗНООБРАЗИЕ
Финансирование:
Работа поддержана бюджетной темой ИОЭБ СО РАН АААА-А17-117011810034-9
Коды:
Аннотация:
Цель исследования — определить природные пептидазы в микробном мате горячего источника Гарга и их разнообразие. Статья посвящена комплексному исследованию пептидаз, которые представляют отдельную группу гидролитических ферментов участвующие в разложение органического вещества. Научная новизна работы заключается в анализе препаратов микробных сообществ горячих источников Байкальской рифтовой зоны методом высокопроизводительного секвенирования, которые обеспечивают гидролиз биополимеров на первых этапах деструкции органического вещества. В результате был проведен метагеномный анализ, который позволил выявить распространение пептидаз класса металлопептидаз в изученных микробных сообществах. В метагеномных последовательностях были идентифицированы потенциальные пептидазы, которые могут представлять биотехнологический интерес.
Ключевые слова:
пептидазы; микробный мат; гидролитические ферменты; металлопептидазы; метагеномомы; секвенирование; Байкальская рифтовая зона.
Список литературы:
Замана Л. В., Хахинов В. В., Данилова Э. В., Бархутова Д. Д. Гидрохимия мине- ральных вод // Геохимическая деятельность микроорганизмов гидротерм Байкальской рифтовой зоны. Новосибирск: Академическое изд-во «Гео». 2011. С. 62–101.
Obayashi Y., Ueoka N., Suzuki S. Degradation and utilization of protein derived from Pseudomonas aeruginosa by marine microbial community // J. Oceanogr. 2010. V. 6. P. 513– 521.
Oliveira A. S., Filho J. X., Sales M. P. Cysteine proteinases cystatins // Braz Arch Biol Technol. 2003. V. 46, № 1. P. 91–104.
Orsi W. D., Smith J. M., Liu S. and oth. Diverse, uncultivated bacteria and archaea underlying the cycling of dissolved protein in the ocean // ISME J. 2016. V. 10. P. 2158–2173.
Vranova V., Rejsek K., Formanek P. Proteolytic activity in soil: A review // Applied Soil Ecology. 2013. V. 70. P. 23–32.
Rao M. B., Tanksale A. M., Ghatge M. S., Deshpande V. V. Molecular and biotechnological aspects of microbial proteases // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1998. V. 62, № 3. P. 597–635.
Rawlings N. D. and Barrett A. J. Evolutionary families of peptidases // Biochem. J. 1993. V. 290. P. 205–218.
Obayashi Y., Ueoka N., Suzuki S. Degradation and utilization of protein derived from Pseudomonas aeruginosa by marine microbial community // J. Oceanogr. 2010. V. 6. P. 513– 521.
Oliveira A. S., Filho J. X., Sales M. P. Cysteine proteinases cystatins // Braz Arch Biol Technol. 2003. V. 46, № 1. P. 91–104.
Orsi W. D., Smith J. M., Liu S. and oth. Diverse, uncultivated bacteria and archaea underlying the cycling of dissolved protein in the ocean // ISME J. 2016. V. 10. P. 2158–2173.
Vranova V., Rejsek K., Formanek P. Proteolytic activity in soil: A review // Applied Soil Ecology. 2013. V. 70. P. 23–32.
Rao M. B., Tanksale A. M., Ghatge M. S., Deshpande V. V. Molecular and biotechnological aspects of microbial proteases // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1998. V. 62, № 3. P. 597–635.
Rawlings N. D. and Barrett A. J. Evolutionary families of peptidases // Biochem. J. 1993. V. 290. P. 205–218.
Статья.pdf