Природа Внутренней Азии
Библиографическое описание:
, , , , РАСПРОСТРАНЕНИЕ ПРОТЕОЛИТИЧЕСКИХ БАКТЕРИЙ В ХОЛОДНЫХ ИСТОЧНИКАХ БУКСЫХЕН (СЕВЕРНОЕ ПРИБАЙКАЛЬЕ) // Природа Внутренней Азии. - 2020. №2(15). . - С. 24-36.
Заглавие:
РАСПРОСТРАНЕНИЕ ПРОТЕОЛИТИЧЕСКИХ БАКТЕРИЙ В ХОЛОДНЫХ ИСТОЧНИКАХ БУКСЫХЕН (СЕВЕРНОЕ ПРИБАЙКАЛЬЕ)
Финансирование:
Коды:
Аннотация:
В холодных источниках Буксыхен (Северное Прибайкалье) рассмотрено пространственно-временное распространение гетеротрофных бактерий, в частности протеолитической группы. Показано, что воды пяти выходов источников Буксыхен явля- ются постоянно холодными, пресными и слабощелочными и относятся к гидрокар- бонатному кальциевому типу. Сравнительный анализ не выявил сезонных изменений в распространении гетеротрофных бактерий. Численность аэробных и анаэробных протеолитических бактерий, независимо от типа пробы, была достаточно высокой и достигала 106 кл/мл. Впервые из источников Буксыхен-щитовидный и Буксыхен- желудочный выделены чистые культуры психротолерантных протеолитических факультативно-анаэробных бактерий родов Janthinobacterium и Yersinia, по предвари- тельным данным, представляющие новые виды данных таксонов.
Ключевые слова:
холодные источники; микробное сообщество; гетеротрофные бактерии; протеолитические бактерии; психрофильные и психротолерантные бактерии.
Список литературы:
Аринушкина Е. В. Руководство по химическому анализу почв. М.: Изд-во Моск. ун-та, 1970. 488 с.
Ульзетуева И. Д., Хахинов В. В. Гидрохимическая характеристика минеральных источников Юго-Западного Забайкалья // Водные ресурсы. 2011. Т. 38, № 5. С. 585–592.
Anesio A. M., Lutz S., Chrismas N. A. M., Benning L. G. The microbiome of glaciers and ice sheets // NPJ Biofilms Microbiomes. 2017. V. 3, № 10. DOI:10.1038/s41522-017-0019-0
Boetius A., Anesio A. M., Deming J. W., Mikucki J. A., Rapp J. Z. Microbial ecology of the cryosphere: sea ice and glacial habitats // Nat. Rev. Microbiol. 2015. V. 13, № 11. Pp. 677– 690. doi:10.1038/nrmicro3522
Brambilla E. et al. 16S rDNA diversity of cultured and uncultured prokaryotes of a mat sample from Lake Fryxell, McMurdo Dry Valleys, Antarctica // Extremophiles. 2001. V. 5, № 1. Pp. 23–33.
Brinkmeyer R., Knittel K., Jürgens J., Weyland H., Amann R. Helmke E. Diversity and Structure of Bacterial CommunitiesinArctic versusAntarctic Pack Ice //Applied and environmental microbiology. 2003. V. 69. Pp. 6610-6619. doi:10.1128/AEM.69.11.6610-6619.2003.
Camacho A., Rochera C., Silvestre J. José, Vicente E., Hahn M. W. Spatial Dominance and Inorganic Carbon Assimilation by Conspicuous Autotrophic Biofilms in a Physical and Chemical Gradient of a Cold Sulfurous Spring: The Role of Differential Ecological Strategies // Microbial ecology. 2005. V. 50. Pp. 172–184. doi:10.1007/s00248-004-0156-x
Chaudhary A., Haack Sh. K., Duris J. W., Marsh T.L. Bacterial and Archaeal Phylogenetic Diversity of a Cold Sulfur-Rich Spring on the Shoreline of Lake Erie, Michigan // Applied and Environmental Microbiology. 2009. V. 75, № 15. Pp. 5025–5036. doi:10.1128/AEM.00112-09
Gerdes B., Brinkmeyer R., Dieckmann G., Helmke E. Influence of crude oil on changes of bacterial communities in Arctic sea-ice // FEMS Microb. Ecol. 2005. V. 53, № 1. Pp. 129–139.
Hungate R. E. A roll tube method for cultivation of strict anaerobes // In: Methods in microbiology 13. Eds. Norris J. R., Ribbons D. W. New York: Acad. 1969. V. 1. P. 117.
Harder T. Marine epibiosis: сoncepts, ecological consequences and host defence // Mar. Indust. Biofouling. 2009. V. 4. Pp. 219–231.
Hotaling S., Finn D. S., Joseph Giersch J., Weisrock D. W., Jacobsen D. Climate change and alpine stream biology: progress, challenges, and opportunities for the future // Biol Rev Camb Philos Soc. 2017. V. 92. № 4. Pp. 2024–2045. doi:10.1111/brv.12319
Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., and Tamura K. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms // Molecular Biology and Evolution. 2018. V. 35. Pp. 1547–1549.
Li G.H., Jiang W., Hou S. Wang L., Huang H., Ren S., Deng H., Dong. Microbial diversity in two cold springs on the Qinghai-Tibetan Plateau // Geosci. Front. 2012. V. 3. Pp. 317–325. doi:10.1016/j.gsf.2011.12.004.
Margesin R., Miteva V. Diversity and ecology of psychrophilic microorganisms // Res. Microbiol. 2011. V. 162, № 3. Pp. 346–361. doi:10.1016/j.resmic.2010.12.004
Martin A., McMinn A. Sea ice, extremophiles and life on extra-terrestrial ocean worlds // Int. J. Astrobiol. 2018. V. 17, № 1. Pp. 1–16.
Perreault N. N., Andersen D. T., Pollard W. H., Greer C. W., Whyte L. G. Characterization of the prokaryotic diversity in cold saline perennial springs of the Canadian high Arctic // Applied and environmental microbiology. 2007. V. 73, № 5. Pp. 1532–1543. doi.org/10.1128/ AEM.01729-06
Perreault N. N., Greer C. W., Andersen D. T., Tille S., Lacrampe-Couloume G., Lollar B. Sh., Whyte, L. G. Heterotrophic and Autotrophic Microbial Populations in Cold Perennial Springs of the High Arctic // Applied and Environmental Microbiology. 2008. V. 74. Pp. 6898– 6907. doi:10.1128/AEM.00359-08
Rudolph C, Wanner G, Huber R. Natural communities of novel archaea and bacteria growing in cold sulfurous springs with a string-of-pearls-like morphology // Applied and Environmental Microbiology. 2001 V. 67, №. 5. Pp. 2336–2344. doi:10.1128/aem.67.5.2336- 2344.2001.
Saitou N. and Nei M. The neighbor-joining method: A new method for reconstructing phylogenetic trees // Molecular Biology and Evolution. 1987. V. 4. Pp. 406–425.
Shivaji S. Ray, M. K., Kumar, G. S., Reddy G. S. N., Saisree L., Wynn-Williams D. D. Identification of Janthinobacterium lividum from the soils of the islands of Scotia Ridge and from Antarctic peninsula // Polar biology. 1991. V. 11, № 4. Pp. 267–271.
Schloss P. D., Allen H. K., Klimowicz A. K., Mlot C., Gross J.A., Savengsuksa S., McEllin J., Clardy J., Ruess R. W., Handelsman J. Psychrotrophic strain of Janthinobacterium lividum from a cold Alaskan soil produces prodigiosin // DNA and cell biology. 2010. V. 29. №. 9. Pp. 533–541.
Tamura K., Nei M., and Kumar S. Prospects for inferring very large phylogenies by using the neighbor-joining method // Proceedings of the National Academy of Sciences (USA). 2004. V. 101. Pp. 11030–11035.
Ульзетуева И. Д., Хахинов В. В. Гидрохимическая характеристика минеральных источников Юго-Западного Забайкалья // Водные ресурсы. 2011. Т. 38, № 5. С. 585–592.
Anesio A. M., Lutz S., Chrismas N. A. M., Benning L. G. The microbiome of glaciers and ice sheets // NPJ Biofilms Microbiomes. 2017. V. 3, № 10. DOI:10.1038/s41522-017-0019-0
Boetius A., Anesio A. M., Deming J. W., Mikucki J. A., Rapp J. Z. Microbial ecology of the cryosphere: sea ice and glacial habitats // Nat. Rev. Microbiol. 2015. V. 13, № 11. Pp. 677– 690. doi:10.1038/nrmicro3522
Brambilla E. et al. 16S rDNA diversity of cultured and uncultured prokaryotes of a mat sample from Lake Fryxell, McMurdo Dry Valleys, Antarctica // Extremophiles. 2001. V. 5, № 1. Pp. 23–33.
Brinkmeyer R., Knittel K., Jürgens J., Weyland H., Amann R. Helmke E. Diversity and Structure of Bacterial CommunitiesinArctic versusAntarctic Pack Ice //Applied and environmental microbiology. 2003. V. 69. Pp. 6610-6619. doi:10.1128/AEM.69.11.6610-6619.2003.
Camacho A., Rochera C., Silvestre J. José, Vicente E., Hahn M. W. Spatial Dominance and Inorganic Carbon Assimilation by Conspicuous Autotrophic Biofilms in a Physical and Chemical Gradient of a Cold Sulfurous Spring: The Role of Differential Ecological Strategies // Microbial ecology. 2005. V. 50. Pp. 172–184. doi:10.1007/s00248-004-0156-x
Chaudhary A., Haack Sh. K., Duris J. W., Marsh T.L. Bacterial and Archaeal Phylogenetic Diversity of a Cold Sulfur-Rich Spring on the Shoreline of Lake Erie, Michigan // Applied and Environmental Microbiology. 2009. V. 75, № 15. Pp. 5025–5036. doi:10.1128/AEM.00112-09
Gerdes B., Brinkmeyer R., Dieckmann G., Helmke E. Influence of crude oil on changes of bacterial communities in Arctic sea-ice // FEMS Microb. Ecol. 2005. V. 53, № 1. Pp. 129–139.
Hungate R. E. A roll tube method for cultivation of strict anaerobes // In: Methods in microbiology 13. Eds. Norris J. R., Ribbons D. W. New York: Acad. 1969. V. 1. P. 117.
Harder T. Marine epibiosis: сoncepts, ecological consequences and host defence // Mar. Indust. Biofouling. 2009. V. 4. Pp. 219–231.
Hotaling S., Finn D. S., Joseph Giersch J., Weisrock D. W., Jacobsen D. Climate change and alpine stream biology: progress, challenges, and opportunities for the future // Biol Rev Camb Philos Soc. 2017. V. 92. № 4. Pp. 2024–2045. doi:10.1111/brv.12319
Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., and Tamura K. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms // Molecular Biology and Evolution. 2018. V. 35. Pp. 1547–1549.
Li G.H., Jiang W., Hou S. Wang L., Huang H., Ren S., Deng H., Dong. Microbial diversity in two cold springs on the Qinghai-Tibetan Plateau // Geosci. Front. 2012. V. 3. Pp. 317–325. doi:10.1016/j.gsf.2011.12.004.
Margesin R., Miteva V. Diversity and ecology of psychrophilic microorganisms // Res. Microbiol. 2011. V. 162, № 3. Pp. 346–361. doi:10.1016/j.resmic.2010.12.004
Martin A., McMinn A. Sea ice, extremophiles and life on extra-terrestrial ocean worlds // Int. J. Astrobiol. 2018. V. 17, № 1. Pp. 1–16.
Perreault N. N., Andersen D. T., Pollard W. H., Greer C. W., Whyte L. G. Characterization of the prokaryotic diversity in cold saline perennial springs of the Canadian high Arctic // Applied and environmental microbiology. 2007. V. 73, № 5. Pp. 1532–1543. doi.org/10.1128/ AEM.01729-06
Perreault N. N., Greer C. W., Andersen D. T., Tille S., Lacrampe-Couloume G., Lollar B. Sh., Whyte, L. G. Heterotrophic and Autotrophic Microbial Populations in Cold Perennial Springs of the High Arctic // Applied and Environmental Microbiology. 2008. V. 74. Pp. 6898– 6907. doi:10.1128/AEM.00359-08
Rudolph C, Wanner G, Huber R. Natural communities of novel archaea and bacteria growing in cold sulfurous springs with a string-of-pearls-like morphology // Applied and Environmental Microbiology. 2001 V. 67, №. 5. Pp. 2336–2344. doi:10.1128/aem.67.5.2336- 2344.2001.
Saitou N. and Nei M. The neighbor-joining method: A new method for reconstructing phylogenetic trees // Molecular Biology and Evolution. 1987. V. 4. Pp. 406–425.
Shivaji S. Ray, M. K., Kumar, G. S., Reddy G. S. N., Saisree L., Wynn-Williams D. D. Identification of Janthinobacterium lividum from the soils of the islands of Scotia Ridge and from Antarctic peninsula // Polar biology. 1991. V. 11, № 4. Pp. 267–271.
Schloss P. D., Allen H. K., Klimowicz A. K., Mlot C., Gross J.A., Savengsuksa S., McEllin J., Clardy J., Ruess R. W., Handelsman J. Psychrotrophic strain of Janthinobacterium lividum from a cold Alaskan soil produces prodigiosin // DNA and cell biology. 2010. V. 29. №. 9. Pp. 533–541.
Tamura K., Nei M., and Kumar S. Prospects for inferring very large phylogenies by using the neighbor-joining method // Proceedings of the National Academy of Sciences (USA). 2004. V. 101. Pp. 11030–11035.
Статья.pdf