Природа Внутренней Азии
Библиографическое описание:
, , , , ТАКСОНОМИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ МИКРОБНОГО СООБЩЕСТВА В РАЗЛИЧНЫХ ТЕРМАЛЬНЫХ ЗОНАХ ГОРЯЧЕГО ИСТОЧНИКА ГАРГА (БАЙКАЛЬСКАЯ РИФТОВАЯ ЗОНА) // Природа Внутренней Азии. - 2023. №3(25). . - С. 58-67.
Заглавие:
ТАКСОНОМИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ МИКРОБНОГО СООБЩЕСТВА В РАЗЛИЧНЫХ ТЕРМАЛЬНЫХ ЗОНАХ ГОРЯЧЕГО ИСТОЧНИКА ГАРГА (БАЙКАЛЬСКАЯ РИФТОВАЯ ЗОНА)
Финансирование:
Работа выполнена в рамках темы госзадания № 121030100229-1.
Коды:
Аннотация:
Изучено таксономическое разнообразие микробного сообщества микроб- ных матов и донных осадков с использованием анализа ампликонов гена 16S рРНК. В данных образцах микробных матов доминировали Pseudomonadota, Cyanobacteriota, Ignavibacteriota, Chloroflexota и Deinococcota. С понижением температуры возрас- тает доля представителей Bacillota, Actinomycetota. В микробном сообществе донных осадков во всех изученных термальных зонах доминируют представители филумов Pseudomonadota, Bacteroidota, содоминантами в донных осадках являлись Bacillota. Проведенные исследования позволили установить таксономический состав и соотно- шение основных групп микроорганизмов в микробных сообществах микробных матов и донных осадков в горячем источнике Гарга.
Ключевые слова:
таксономическое разнообразие, 16S рРНК, температурные зоны, горячий источник, микробный мат, донные осадки, Байкальская рифтовая зона
Список литературы:
Геохимическая деятельность микроорганизмов гидротерм Байкальской рифтовой зоны / Б. Б. Намсараев, Д. Д. Бархутова, Э. В. Данилова [и др.]. Новосибирск : Гео, 2011. 302 с. Текст : непосредственный.
Филогенетический анализ микробного мата в горячем источнике Гарга (Байкаль- ская рифтовая зона) и разнообразие природных пептидаз / Е. В. Лаврентьева, А. А. Рад- нагуруева, Т. Г. Банзаракцаева [и др.] // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2017.
№ 21(8). С. 959–963. DOI 10.18699/VJ17.319. Текст : непосредственный.
Bonch-Osmolovskaya E. A., Miroshnichenko M. L., Slobodkin A. I. et al. Biodiversity of Anaerobic Lithotrophic Prokaryotes in Terrestrial Hot Springs of Kamchatka. Microbiology (Moscow). 1999; 68: 343–351.
Bonch-Osmolovskaya E. A. Thermophilic Microorganisms: a general overview. Proc. Winogradsky Inst. Microbiol. In: V. F. Galchenko (ed.) Thermophilic microorganisms. Moscow, 2011, pp. 5–14
Brouchkov A., Kabilov M., Filippova S. et al. Bacterial Community in Ancient Permafrost Alluvium at the Mammoth Mountain (Eastern Siberia). Gene. 2017; 636: 48‒53. https://doi. org/10.1016/j.gene.2017.09.021.
Coman C., Drugă B., Hegedus A. et al. Archaeal and Bacterial Diversity in Two Hot Spring Microbial Mats from a Geothermal Region in Romania. Extremophiles. 2013; 17: 523–534.
Edgar R. C. UPARSE: Highly Accurate OTU Sequences from Microbial Amplicon Reads. Nat. Methods. 2013; 10: 996–998.
Everroad R. C., Otaki H., Matsuura K., and Haruta S. Diversification of Bacterial Community Composition along a Temperature Gradient at a Thermal Spring. Microbes Environ. 2012; 27: 374–381.
Fadrosh D. W., Ma B., Gajer P. et al. An Improved Dual-Indexing Approach for Multiplexed 16S rRNA Gene Sequencing on the Illumina MiSeq Platform. Microbiome. 2014; 2. Art. 6: 1‒7. https://doi.org/10.1186/2049-2618-2-6
Gumerov V. M., Mardanov A. V., Beletsky A. V. et al. Molecular Analysis of Microbial diversity in the Zavarzin Spring, Uzon Caldera, Kamchatka. Microbiology (Moscow). 2011; 80: 244–251.
Klatt C. G., Wood J. M., Rusch D. B. et al. Community Ecology of Hot Spring Cyanobacterial Mats: Predominant Populations and their Functional Potential. ISME J. 2011; 5: 1262–1278.
Podar P. T., Yang Z., Björnsdóttir S. H., and Podar M. Comparative Analysis of Microbial Diversity across Temperature Gradients in Hot Springs from Yellowstone and Iceland. Front. Microbiol. 2020; 11: 1625. doi: 10.3389/fmicb.2020.01625.
Rozanov A. S., Bryanskaya A. V., Ivanisenko T. V. et al. Biodiversity of the Microbial Mat of the Garga Hot Spring. BMC Evol Biol. 2017; Dec 28, 17(Suppl 2): 254. doi: 10.1186/ s12862-017-1106-9. PMID: 29297382; PMCID: PMC5751763.
Song Z. Q., Wang F. P., Zhi X. Y. et al. Bacterial and Archaeal Diversities in Yunnan and Tibetan Hot Springs, China. Environ. Microbiol. 2013; 15(4): 1160–1175.
Wang S., Hou W., Dong H. et al. Control of Temperature on Microbial Community Structure in Hot Springs of the Tibetan Plateau. PLoS One. 2013; 8(5): e62901.
Филогенетический анализ микробного мата в горячем источнике Гарга (Байкаль- ская рифтовая зона) и разнообразие природных пептидаз / Е. В. Лаврентьева, А. А. Рад- нагуруева, Т. Г. Банзаракцаева [и др.] // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2017.
№ 21(8). С. 959–963. DOI 10.18699/VJ17.319. Текст : непосредственный.
Bonch-Osmolovskaya E. A., Miroshnichenko M. L., Slobodkin A. I. et al. Biodiversity of Anaerobic Lithotrophic Prokaryotes in Terrestrial Hot Springs of Kamchatka. Microbiology (Moscow). 1999; 68: 343–351.
Bonch-Osmolovskaya E. A. Thermophilic Microorganisms: a general overview. Proc. Winogradsky Inst. Microbiol. In: V. F. Galchenko (ed.) Thermophilic microorganisms. Moscow, 2011, pp. 5–14
Brouchkov A., Kabilov M., Filippova S. et al. Bacterial Community in Ancient Permafrost Alluvium at the Mammoth Mountain (Eastern Siberia). Gene. 2017; 636: 48‒53. https://doi. org/10.1016/j.gene.2017.09.021.
Coman C., Drugă B., Hegedus A. et al. Archaeal and Bacterial Diversity in Two Hot Spring Microbial Mats from a Geothermal Region in Romania. Extremophiles. 2013; 17: 523–534.
Edgar R. C. UPARSE: Highly Accurate OTU Sequences from Microbial Amplicon Reads. Nat. Methods. 2013; 10: 996–998.
Everroad R. C., Otaki H., Matsuura K., and Haruta S. Diversification of Bacterial Community Composition along a Temperature Gradient at a Thermal Spring. Microbes Environ. 2012; 27: 374–381.
Fadrosh D. W., Ma B., Gajer P. et al. An Improved Dual-Indexing Approach for Multiplexed 16S rRNA Gene Sequencing on the Illumina MiSeq Platform. Microbiome. 2014; 2. Art. 6: 1‒7. https://doi.org/10.1186/2049-2618-2-6
Gumerov V. M., Mardanov A. V., Beletsky A. V. et al. Molecular Analysis of Microbial diversity in the Zavarzin Spring, Uzon Caldera, Kamchatka. Microbiology (Moscow). 2011; 80: 244–251.
Klatt C. G., Wood J. M., Rusch D. B. et al. Community Ecology of Hot Spring Cyanobacterial Mats: Predominant Populations and their Functional Potential. ISME J. 2011; 5: 1262–1278.
Podar P. T., Yang Z., Björnsdóttir S. H., and Podar M. Comparative Analysis of Microbial Diversity across Temperature Gradients in Hot Springs from Yellowstone and Iceland. Front. Microbiol. 2020; 11: 1625. doi: 10.3389/fmicb.2020.01625.
Rozanov A. S., Bryanskaya A. V., Ivanisenko T. V. et al. Biodiversity of the Microbial Mat of the Garga Hot Spring. BMC Evol Biol. 2017; Dec 28, 17(Suppl 2): 254. doi: 10.1186/ s12862-017-1106-9. PMID: 29297382; PMCID: PMC5751763.
Song Z. Q., Wang F. P., Zhi X. Y. et al. Bacterial and Archaeal Diversities in Yunnan and Tibetan Hot Springs, China. Environ. Microbiol. 2013; 15(4): 1160–1175.
Wang S., Hou W., Dong H. et al. Control of Temperature on Microbial Community Structure in Hot Springs of the Tibetan Plateau. PLoS One. 2013; 8(5): e62901.
Статья.pdf