Природа Внутренней Азии
Библиографическое описание:
, , , , , СТРУКТУРА И РАЗНООБРАЗИЕ МИКРОБНОЙ СОЛЕВОЙ КОРКИ В СУЛЬФАТНОМ ОЗЕРЕ ГУДЖИРГАНСКОЕ БАРГУЗИНСКОЙ КОТЛОВИНЫ (БУРЯТИЯ) // Природа Внутренней Азии. - 2022. №4(22). . - С. 50-58.
Заглавие:
СТРУКТУРА И РАЗНООБРАЗИЕ МИКРОБНОЙ СОЛЕВОЙ КОРКИ В СУЛЬФАТНОМ ОЗЕРЕ ГУДЖИРГАНСКОЕ БАРГУЗИНСКОЙ КОТЛОВИНЫ (БУРЯТИЯ)
Финансирование:
Коды:
Аннотация:
Озеро Гуджирганское — это уникальный природный комплекс экстремаль- ных экологических условий, где резкие сезонные и суточные перепады температуры, нестабильный водный режим, значительные колебания солености и температуры воды, выпадение солей на поверхности озера, в свою очередь, определяют структуру микробного сообщества в озере. С использованием технологий высокопроизводительного секвенирования изучено разнообразие прокариот в солевых корках. Основу микробного сообщества составили представители γ-Proteobacteria;α-Proteobacteria, Firmicutes и Bacteroidetes. На родовом уровне представлены галофильные и умеренно галофильные алкалофильные бактерии, а также обнаружены последовательности генов 16S рРНК, которые не могут быть клас- сифицированы на уровне родов, что указывает на потенциально новых представителей Bacteria, присутствующих в этой экстремальной экосистеме.
Ключевые слова:
сульфатное озеро, микробное сообщество, солевые корки, разнообразие, высокопроизводительное секвенирование, ген 16S рРНК.
Список литературы:
Плюснин А. М., Перязева Е. Г., Чернявский М. К., Жамбалова Д. И., Будаев Р. Ц., Ангахаева Н. А. Генезис воды и растворенных веществ содовых озер Нижнего Куй- туна Баргузинской впадины // География и природные ресурсы. 2020. № 3. С. 89–97. DOI: 10.21782/GIPR0206-1619-2020-3(89-97). Тесст : непосредственный.
Asker D., Awad T. S., McLandsborough L., Beppu T., Ueda K. Deinococcus depoly- merans sp. nov., a gamma- and UV-radiation-resistant bacterium, isolated from a naturally radioactive site. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2011; 61: 1448–1453.
Edgar R. C. SINTAX: a simple non-Bayesian taxonomy classifier for 16S and ITS Sequences. BioRxiv preprint, 2016, p.20. doi:10.1101/074161.
Wang Y.-N., Cai H., Chi C.-Q., Lu A.-H., Lin X.-G., Jiang Z.-F., Wu X.-L. Halomonas shengliensis sp. nov., a moderately halophilic, denitrifying, crude-oil-utilizing bacterium. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007; 57(6): 1222–1226. doi: 10.1099/ijs.0.64973-0
Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. Mol. Biol. Evol. 2013; 30: 2725–2729.
Edgar R. C. UPARSE: highly accurate OTU sequences from microbial amplicon reads. Nat. Methods. 2013; 10: 996–998.
Farías M. E., Contreras M., Rasuk M. C., Kurth D., Flores M. R., Poiré D. G., Novoa F., Visscher P. T. Characterization of bacterial diversity associated with microbial mats, gypsum evaporites and carbonate microbialites in thalassic wetlands: Tebenquiche and La Brava, Salar de Atacama Chile. Extremophiles. 2014; 18(2): 311–29. doi:10.1007/s00792-013-0617-6
Rothschild L. J., and Mancinelli R. L. Life in extreme environments. Nature. 2001; 409: 1092–1101. doi: 10.1038/35059215
Theodorakopoulos N., Bachar D., Christen R., Alain K., Chapon V. Exploration of Deinococcus-Thermus molecular diversity by novel group-specific PCR primers. Microbiology Open. 2013; 2(5): 862–872. doi: 10.1002/mbo3.119ff7.
Wierzchos J., Ascaso C., and McKay C. P. Endolithic cyanobacteria in halite rocks from the hyperarid core of the Atacama Desert. Astrobiology. 2006; 6: 415–422. doi: 10.1089/ ast.2006.6.415.
Asker D., Awad T. S., McLandsborough L., Beppu T., Ueda K. Deinococcus depoly- merans sp. nov., a gamma- and UV-radiation-resistant bacterium, isolated from a naturally radioactive site. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2011; 61: 1448–1453.
Edgar R. C. SINTAX: a simple non-Bayesian taxonomy classifier for 16S and ITS Sequences. BioRxiv preprint, 2016, p.20. doi:10.1101/074161.
Wang Y.-N., Cai H., Chi C.-Q., Lu A.-H., Lin X.-G., Jiang Z.-F., Wu X.-L. Halomonas shengliensis sp. nov., a moderately halophilic, denitrifying, crude-oil-utilizing bacterium. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007; 57(6): 1222–1226. doi: 10.1099/ijs.0.64973-0
Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. Mol. Biol. Evol. 2013; 30: 2725–2729.
Edgar R. C. UPARSE: highly accurate OTU sequences from microbial amplicon reads. Nat. Methods. 2013; 10: 996–998.
Farías M. E., Contreras M., Rasuk M. C., Kurth D., Flores M. R., Poiré D. G., Novoa F., Visscher P. T. Characterization of bacterial diversity associated with microbial mats, gypsum evaporites and carbonate microbialites in thalassic wetlands: Tebenquiche and La Brava, Salar de Atacama Chile. Extremophiles. 2014; 18(2): 311–29. doi:10.1007/s00792-013-0617-6
Rothschild L. J., and Mancinelli R. L. Life in extreme environments. Nature. 2001; 409: 1092–1101. doi: 10.1038/35059215
Theodorakopoulos N., Bachar D., Christen R., Alain K., Chapon V. Exploration of Deinococcus-Thermus molecular diversity by novel group-specific PCR primers. Microbiology Open. 2013; 2(5): 862–872. doi: 10.1002/mbo3.119ff7.
Wierzchos J., Ascaso C., and McKay C. P. Endolithic cyanobacteria in halite rocks from the hyperarid core of the Atacama Desert. Astrobiology. 2006; 6: 415–422. doi: 10.1089/ ast.2006.6.415.
Статья.pdf